首都医学科学创新中心-计算机辅助药物设计服务

计算机辅助药物设计服务

计算机辅助药物设计（Computer-aided drug design，CADD）是⼀类借助计算方法来加速药物研发的技术。平台配置有高性能计算集群以及专业的药物计算软件，可在小分子先导化合物的发现与优化阶段提供计算支持。主要提供虚拟筛选、分子对接、分子动力学模拟、结合自由能计算等服务，并持续开发及扩展更多计算服务。

主要技术服务

主要技术参数

虚拟筛选 (Virtual Screening, VS) 基于小分子化合物库开展，可快速从几十至上百万分子中，筛选出具有潜在活性的化合物，并对化合物进行实验验证。虚拟筛选可以缩短研究周期，降低研发成本，是现代药物研发中常⽤的先导化合物筛选技术之⼀。根据受体结构的有无，分为基于受体的虚拟筛选（Receptor Based Virtual Screening, RBVS）和基于配体的虚拟筛选（Ligand Based Virtual Screening, LBVS）。

分子对接（Molecular Docking）是通过计算模拟小分子在受体活性位点的结合模式。通过对⼩分⼦进⾏构象搜索以探索与受体不同的结合模式。通过打分函数对每种结合模式进⾏评估和排序，选择最优的结合构象进⾏分析展⽰，从而用于指导小分子化合物的结构优化。根据对接过程中配受体构象是否发生变化将分子对接分为刚性对接、柔性对接和半柔性对接。

基于配体的虚拟筛选即基于药效团模型的虚拟筛选，是根据现有药物的结构、理化性质和活性关系的分析，建立定量构效关系或药效团模型，从而筛选具有潜在活性的化合物。

(虚拟筛选流程示意图)

分子对接