首都医学科学创新中心-刘时昱

研究人员

刘时昱

shiyu.liu(at)cimrbj.ac.cn

研究员

代谢流分析、计算代谢生理学、稳定同位素示踪、

代谢性疾病、多组学整合

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shiyu.liu(at)cimrbj.ac.cn

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北京大学生物科学学士

杜克大学计算生物学与生物信息学博士

工作经历

2025.1至今

首都医学科学创新中心医学生理学研究所研究员

2021.12-2025.1

杜克大学医学院药理学与癌症生物学系博士后

研究方向

刘时昱实验室以代谢流分析为核心技术，结合先进的生理学、多组学、计算建模与遗传学方法，致力于定量刻画生物体内复杂代谢网络的基本规律，并将这些认识转化为针对常见代谢性疾病的创新治疗策略。实验室当前的主要研究方向包括：

1. 代谢流分析算法、软件及标准化实验流程的开发与优化，致力于提供更高效、准确、易用的代谢研究工具。
2. 基于代谢流分析的多器官复杂代谢网络研究，定量刻画动物和人体内的代谢生理活动，并揭示肥胖、痛风等代谢性疾病的机制。
3. 代谢流分析与空间代谢组学及单细胞代谢网络的结合，研究器官内不同细胞的代谢异质性及其与组织器官生理和病理活动的关联。
4. 结合代谢网络模型与多组学数据，推断生物体内多器官之间的代谢相互作用。

主要成果与贡献

1. 构建了多器官代谢网络，定量分析了血浆中的葡萄糖和乳酸在小鼠各器官三羧酸循环（TCA循环）中的贡献（Cell Metabolism, 2020）。

2. 分析了果蝇的能量代谢流，以解释甲硫氨酸限制饮食对其寿命和生育力影响的代谢机制（Nature Aging, 2024，第二作者）。

3. 开发了一种用于评估代谢流分析结果准确性的新方法，并基于评估结果改进了代谢流分析流程以提升其精确性和稳健性（Nature Metabolism, 2024）。

代表性文章 *：共同第一作者; #：共同通讯作者

Liu S, Liu X & Locasale JW. Quantification of metabolic activity from isotope tracing data using automated methodology. Nature Metabolism, 2024. DOI: 10.1038/s42255-024-01144-2

Wei F, Liu S, Liu J, Sun Y, Allen A, Reid MA & Locasale JW. Separation of reproductive decline from lifespan extension. Nature Aging, 2024, 4: 1089-1101. DOI: 10.1038/s43587-024-00674-4

Liu S & Locasale JW. Delineating a role for methionine metabolism in colorectal cancer. Cancer Research, 2023, 83: 3833–3834. DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-23-3169

Liu S, Dai Z, Cooper DE, Kirsch DG & Locasale JW. Quantitative Analysis of the Physiological Contributions of Glucose to the TCA Cycle. Cell Metabolism, 2020, 32: 619-628.e21. DOI: 10.1016/j.cmet.2020.09.005